Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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Prdm16A2A935 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Prdm16A2A935 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Prdm16A2A935 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Prdm16A2A935 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prdm16A2A935 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Prdm16A2A935 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Prdm16A2A935 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Prdm16A2A935 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Prdm16A2A935 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prdm16A2A935 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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