Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn2r25W4VSP2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms