Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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