Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sh3bgrQ9WUZ7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh3bgrQ9WUZ7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms