Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcm1Q9R0L6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms