Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf4Q9QZS2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf4Q9QZS2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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