Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ripk3Q9QZL0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ripk3Q9QZL0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ripk3Q9QZL0 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ripk3Q9QZL0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ripk3Q9QZL0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ripk3Q9QZL0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ripk3Q9QZL0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ripk3Q9QZL0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ripk3Q9QZL0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk3Q9QZL0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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