Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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