Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hmgn5Q9JL35 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hmgn5Q9JL35 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hmgn5Q9JL35 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hmgn5Q9JL35 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hmgn5Q9JL35 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hmgn5Q9JL35 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hmgn5Q9JL35 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hmgn5Q9JL35 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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