Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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OtofQ9ESF1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
OtofQ9ESF1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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