Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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DysfQ9ESD7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DysfQ9ESD7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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