Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Clstn2Q9ER65 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms