Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Capn12Q9ER56 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Capn12Q9ER56 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Capn12Q9ER56 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms