Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rp2Q9EPK2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms