Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ndufs3Q9DCT2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms