Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Tomm20Q9DCC8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms