Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Smg9Q9DB90 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smg9Q9DB90 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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