Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf138rt1Q9D9M9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms