Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Derl3Q9D8K3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms