Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rep15Q9D7T1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rep15Q9D7T1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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