Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms