Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Odf2lQ9D478 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms