Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms