Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ss18l2Q9D174 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms