Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Q9D131 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Q9D131 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Q9D131 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 666.7 ms