Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gtf2e1Q9D0D5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms