Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cnih4Q9CX13 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cnih4Q9CX13 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cnih4Q9CX13 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cnih4Q9CX13 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnih4Q9CX13 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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