Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RpainQ9CWY9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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