Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpusd4Q9CWX4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rpusd4Q9CWX4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rpusd4Q9CWX4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Rpusd4Q9CWX4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpusd4Q9CWX4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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