Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NubplQ9CWD8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms