Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snw1Q9CSN1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms