Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdm1Q9CQK3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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