Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Higd2aQ9CQJ1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms