Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms