Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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