Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nup155Q99P88 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nup155Q99P88 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms