Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed9Q99KF1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms