Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apobec3Q99J72 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apobec3Q99J72 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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