Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Smim11aQ99J19 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Smim11aQ99J19 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim11aQ99J19 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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