Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb6Q922F4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms