Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab11fip5Q8R361 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms