Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rnf183Q8QZS5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rnf183Q8QZS5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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