Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phf13Q8K2W6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms