Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tbc1d23Q8K0F1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tbc1d23Q8K0F1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms