Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm17Q8JZX4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm17Q8JZX4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm17Q8JZX4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rbm17Q8JZX4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Rbm17Q8JZX4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rbm17Q8JZX4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rbm17Q8JZX4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rbm17Q8JZX4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rbm17Q8JZX4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rbm17Q8JZX4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rbm17Q8JZX4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rbm17Q8JZX4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm17Q8JZX4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rbm17Q8JZX4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms