Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Ercc8Q8CFD5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ercc8Q8CFD5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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