Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc17Q8CE13 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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