Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vwa8Q8CC88 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms