Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ephb1Q8CBF3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ephb1Q8CBF3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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