Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6G0

Ifi27, Interferon, alpha-inducible protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi27Q8C6G0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ifi27Q8C6G0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms